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导语
目录
1. 引言和背景：
还原唯物主义及现代科学世界观的根基
2. 热力学第一和第二定律：
维持和变化的物理基础
图1. 焦耳的桨轮实验。悬挂的重物（机械势能）连接到一个处于绝热容器（没有热量进出）内的桨轮上，并由约束装置固定。当约束装置被移除时，重物下落，带动桨轮转动，从而提高了水的温度。这证明了机械能和热能的等效性，同时总能量保持守恒 [4]。
“分子以相同的速度和相同的方向运动是可以想象的最不可能的情况...... 一种无限不可能的能量构型......”
3. 生命的本质、目的和运作方式？
达尔文主义作为进化理论的缺陷
图2. 随着大气氧气（O₂）水平的升高（PAL = 当前大气水平），机会性地产生越来越高级的有序状态 [21]
4. 颠覆第二定律是“无序定律”的观点：
物理选择或为什么世界会从事秩序生产
图 3. 贝纳德（Benard）对流实验的两个时间切片展示了一种粘性液体，其被置于底部均匀热源（source）和顶部冷空气（热汇（sink））之间。两者的温差产生了一个具有热力学力F的势。当F低于临界阈值时，系统 (a) 处于无序或 '玻尔兹曼状态'，热量通过分子的无序碰撞流动，宏观状态看起来是同质的（homogeneous）。相较之下，(b) 一旦F增加到阈值以上，宏观状态就被从微观状态中选择了出来（从无序流中产生了有序），数以亿计的分子开始集体移动 [5]。
图 4. 典型的自催化动力系统。E（左侧）是守恒量（能量，“世界”），自催化动力系统正是由此产生并以之维持自身。EI 和 EⅡ 分别表示源（能量 E 的非平衡区域）和汇（能量 E 的平衡或接近平衡的区域），它们之间的梯度形成一个势，并产生力 F₁，F₁ 的大小由梯度陡峭程度决定。ΔEI 是流入系统或从该势中流出的能量流，它在输出端转化为熵 ΔS。EⅢ 是系统内部的势，该势由系统的构成关系携带，并根据系统距离平衡态的远近施加反作用力 F₂ 来放大或维持输入能量。（取自 auto-'自我’+cata '向下’+kinetic '物质运动及其相关联的力和能量’） [4,7]。
图 5. 贝纳德对流系统的一般示意图。T₁→T₂是下方热源和上方热汇之间的原始温度梯度，其有一个由温度梯度陡峭程度衡量的力F₁，该力驱动着流。T₃→T₄显示了发展出来的表面温度梯度，其具有力F₂，可反向作用以放大结构的实例化。通过这种自发的秩序构建，系统的时空维度会增加几个数量级 [20]。
图 6. 在类似于图4的简单流体实验中，从无序到有序转变过程中热传输速率的不连续增加（热通量与源/汇梯度关系图）[4]。
第四定律本身并没有直接谈到自发秩序构建，但结合第二定律的平衡方程，很容易推导出普遍的秩序构建原理，即：
如果 热力学第四定律或LMEP成立（世界会选择......速度最快的路径）
并且如果 有序流能比无序流更快地产生熵（第二定律的平衡方程）
5. 生命、信息和“心智”（认知）的进化
6. 结论
参考文献
（参考文献可上下滑动查看）
生命复杂性读书会：生命复杂系统的构成原理
在生物学中心法则的起点，基因作为生命复杂系统的遗传信息载体，在生命周期内稳定存在；而位于中心法则末端的蛋白质，其组织构成和时空变化的复杂性呈指数式增长。随着分子生物学数十年来的突飞猛进，尤其是生命组学（基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等的集合）等领域的日新月异，当代生命科学临近爆发的边缘。如此海量的数据如何帮助我们揭示宇宙中最复杂的物质系统——“人体”的构成原理和设计原理？阐释人类发育、衰老和重大疾病的发生机制？