虽然怪物猎人世界观的科学体系下，多数怪物都已经从界门纲目科属种的角度做了明确、科学的分类，但猎人业界使用的分类法和科学界的并不一样。因此，游戏里实际上存在着学名与常用名的“二名法”（但汉化版，包括官方汉化，除极个别例子使用学名音译外，一律使用了怪物的常用名作为翻译）。
如：雷狼龙（ジンオウガ）
目前本表只收录正史系列中的怪物，因此像《怪物猎人 边境》一类的非正史系列作品中特有的怪物暂不收录。
习惯上有时也被称为“食草种”，自MH1就开始登场，顾名思义，是因为食草的特性而被划分出来的种族。实际上是个“垃圾筐”分类，因为里头同时涵盖了龙与兽，所以是一个“很纯粹的猎人分类”。
草食种大多危害程度较低甚至没有危害，处于食物链的最底层行走的生肉，因此目前并没有任何大型怪物被归入草食种一类（角龙和一角龙虽然也是食草动物，但是其危害性较大且身体结构偏向飞龙，将其划分为飞龙种，类似的还有属于兽龙种的尾槌龙、牙兽种的巨兽等）。代表为食草龙、波波等。
此分类下的龙类怪物大多都属于鸟盘目，也有被归类为龙盘目的冠突龙、突击龙和首鸣龙，以及海龙目的水生食草龙；此分类下的兽类怪物大多都属于偶蹄目和长鼻目。
MH3中首次出现的怪物种类。
包含了各种水生鱼类，其中也包括像咬鱼这样的攻击性鱼类。因为其完全水生的特性故与鱼龙种区分开来，没有大型怪物。
代表为咬鱼等。
以人类科技创造的怪物，目前已知的个体全部为“护龙”，除白炽龙外全部以现存或已灭绝的生物为原型。
既没有繁殖能力，也不会捕食，而是直接摄取龙乳作为能量来源，不过怪物原先的天性也会被放大，在此基础上一些护龙也会根据本能自主活动，甚至恢复进食和繁衍的能力，但依旧无法断绝摄取龙乳的需求。
虽然被称为“造龙种”，但因分类之下存在护辟兽这样的兽类怪物，因此将其视为杂类怪物种群。
尚不清楚造龙种的设定是否是“龙机兵”的延续。
以各种龙，如神话中的龙、现实中的蜥形纲为基底设计的一大类怪物。生态位占据得很宽泛，大多数都是主要怪物。
在科学分类法当中，龙类怪物主要包含了古龙目、龙盘目、鸟盘目、海龙目、翼龙目和蛇龙目这几个类群。
绝大多数龙类怪物体内都能找到一些结石，高品质的结石也被叫做“龙玉”，是制作一些高级武器与防具的关键素材。一些特定品种的龙会产出有特色的结石，如所有鸟龙都会产出“鸟龙玉”、崩霸二龙拥有的独有的结石“霸导玉”和“崩天玉”等。
“龙盘目”和“鸟盘目”这两个日式汉语词汇对应现代汉语词汇“蜥臀目”和“鸟臀目”。不过在现实中，鸟脚亚目属于鸟臀目，而不像MH里那样属于蜥臀目。
望文生义的话，很容易被理解成“古代的龙”，这就错了。如果要解释何谓“古龙”，不妨将这个词展开成“稀奇古怪的龙”。
在MH世界观中，古龙是唯一实现了超脱自然的怪物种类，通常也被认为是最强大的一类怪物。虽然书士队将它们一律归类为“古龙目”，但大家都普遍相信它们之间亲缘关系一定都隔得很远，甚至相信它们跟其他所有怪物都有着完全不一样的祖先。不过由于资料不足，更深一步的考究也就做不动了。
值得注意的是：在日文原版里，古龙的“龙”写作“龍”，而其他龙类怪物的“龙”都写作“竜”。但一些龙人族并不区分这二者，把所有的龙类都叫做“竜”。
判断一种怪物是否属于古龙种，可大概根据下面几个指标来确认：
根据研究，每过百年就会发生一次大规模的古龙迁徙，也就是所谓的“古龙渡”。由于近年来古龙渡突然变得频繁，猎人公会先后组织了一共五个调查团，先后向着古龙迁徙的终点“新大陆”发起了进军，以探明古龙渡背后的秘密。而这也就是MHW故事的起因和核心所在。
外观设计主要分这么几派：
一切古龙都无法捕获。新大陆调查团曾经试图捕获熔山龙，但结果嘛……同时，几乎没有古龙被猎人杀死过（传言称东多尔玛的大长老杀过老山龙，虽然以巨大龙人的战斗力似乎完全有可能，但传言只是传言），除了极个别注定要被猎人杀死的古龙（如天廻龙）。一般来说，能杀死一头古龙的就只有另一头古龙、或和古龙有着相近战斗力的其他怪物。当然，古文明另当别论，毕竟那可是整出了龙机兵这么个禁忌的活儿的怪物文明。
MHWilds中新引入的分类，日文写法为亜龍種，英文写法叫Demi Elder，意为“半个古龙”。
目前而言基本可视为专为天廻龙的幼体黑蚀龙新造的怪物分类，即使按目前最新的曙光设定集中提供的生物树可见其在物种上依旧归类为古龙目廻龙亚目。
自MH1就开始登场，一类尺寸较小、以肉食居多的怪物，科学分类法定义为龙盘目鸟脚亚目名下的所有动物。特征分两派：
根据设定，这三种鸟龙在科学分类法也恰好可以分成鸟龙下目、走龙下目和真鸟下目。鸟脚亚目祖先是一种叫“伊戈尔维斯”的已灭绝古代龙，其外观和当代的鸟龙下目基本相仿。鸟龙下目与走龙下目之间有个已灭绝的过渡类型名为“凯普托斯”，翅膀比较退化，但后腿不如走龙下目发达。
由于鸟龙种占据的生态位不是很高，危险程度也明显弱于那些高人气怪物，这就导致它们普遍成为新手开荒期的boss。上位任务当中可能的鸟龙种狩猎奖励当中有一种通用素材称为“鸟龙玉”。
一些危害性很低的鸟龙种还会被驯化，典例如结云村一带的丸鸟，经常被用来拉小型货车。
以拥有双足飞龙（Wyvern）身体结构为特征的怪物种类，自MH1就开始登场，是目前已知种类最多的物种，也是许多高人气怪物所属的分类。科学分类法定义为龙盘目龙脚亚目名下的所有动物（但崩霸二龙属于一个独立的亚目，只是尚不明朗，因此没命名）。
形态设计主要分三派：
设定上，在MH科学界的研究一直认为，所有的飞龙都有一个共同祖先，也就是雷克斯飞龙，它的生理结构跟如今的轰龙相差不大。但崩龙与霸龙的出现以及后续研究表明，虽然它们也是飞龙一脉，但却在雷克斯飞龙诞生之前就已经存在，这意味着飞龙祖先的年代还要再往前推推。由于这种假定的古代龙一直没有化石出土，书士队将其暂定名为“元祖飞龙”或“始源飞龙”。也正因此，部分猎人索性将崩霸二龙直接视作“始源飞龙”。小型怪物“蛇龙”曾归属于飞龙种名下，后来改名“翼蛇龙”并归入蛇龙种名下，令飞龙种和兽龙种一样成为暂时没有小型怪物的怪物分类。
以拥有鱼类身体结构（如鳍、鳃等部位）为特征的怪物种类。
一部分鱼龙种身体结构上与飞龙种类似，拥有健壮的鱼尾、覆盖全身的鳞片、演化成双足的腹鳍、形似翅膀的修长胸鳍等特征，虽然无法飞行，但却十分擅长在水、沙地等地形敏捷移动，代表为水龙、沙龙等。
另一部分鱼龙种则在身体结构上更加了类似鱼，包括鳞片、流线型身体、短小且呈扇形的鱼鳍等鱼类元素，其中也不乏进化出双腿的类型，代表为泥鱼龙、熔岩龙等。
根据设定，也有不少鱼龙演化出了纯粹水生的生理结构，如已灭绝的古代鱼龙“远古大蛇”，还有破裂龙鱼、爆裂龙鱼和扩散凸眼金鱼等超小型鱼龙。
MH3首次出场的怪物种类，以特化的水生能力为特征的怪物种类。和分类到龙盘目的其他非古龙的龙类怪物不同，海龙种全部属于海龙目。另外不像水龙、沙龙这些鱼龙种，海龙种设定之初就是以水下环境为主场的怪物，因此在MH3和MH3G当中我们会发现，水生的海龙种只要一上岸，立刻就会明显削弱。不过在水下战斗系统被弃用之后，这个游戏设定也就不存在了。
需要注意的是，海龙种只是叫这个名而已。它们的四脚蛇身材很明显保留了上岸活动的能力，况且它们也不像鱼类那样那么对盐度敏感，这就意味着上岸或者在淡水与海水之间迁徙对它们来说并不是一件难事。因此，包括海龙在内的大部分水生海龙种都被确认在淡水水域存在，同时也有多种高度适应陆地环境的海龙种被确认存在海龙种可以出现在任何地方，除了海里。
外观设计主要分三派：
这三个外观设计也恰好分别属于海龙亚目、底足龙亚目和海兽龙亚目。事实上海龙目名下还有一个首长龙亚目，但其名下唯一已知的成员“水生草食龙”因为是植食性而且危害很低，被归类到食草种名下。
由于模型的一系列问题，海龙种最终全部无缘在MHW登场，令一部分猎人感到遗憾，直到MHRise海龙种才终于重见天日。
此类怪物通常体型较大，有着巨大的头部和有力的颌（也有像炎尾龙、沼喷龙这种尖嘴的奇葩），前肢短小到基本无用（碎龙除外）的同时用于站立的后肢异常健壮，尾巴长度基本与躯干持平。兽龙种怪物多为凶暴的肉食动物，但也有吃矿石的（比如爆锤龙）和吃草的（比如尾槌龙和猛牛龙）甚至啃骨头的（比如骨锤龙）。虽然它们都会遁地，但往往只用于逃跑而不是用于攻击。
尽管身体结构高度一致，但兽龙种仍然分化出了相当高的多样性——有特化头部攻击的（如土砂龙和猛牛龙）、有特化尾部攻击的（如尾槌龙、斩龙和炎尾龙）、有以滚代步的（如爆锤龙和骨锤龙两兄弟）、有特化撕咬和吐息攻击的（如恐暴龙和蛮颚龙），甚至把前腿又长回来的（碎龙）也有。大量的观察报告还表明，绝大多数兽龙种都有往皮肤上黏附外物的习性、或用分泌物遮盖皮肤的生理特征。前者的典例有土砂龙、爆锤龙、尾槌龙和碎龙，后者相对较少，比较有名的有土砂龙亚种等。
新大陆研究还发现，部分食肉兽龙种演化出了把猎物衔在嘴里当武器使的习性。有大量来自新大陆的战斗记录表明，蛮颚龙和恐暴龙特别喜欢把贼龙等较小的怪物衔住当大剑使，导致不少猎人吃了大苦头。
MHP3中首次出现，以兼备龙和牙兽特性为特征的怪物种类。科学分类法分类为龙盘目四脚亚目名下的所有动物。
此类怪物与牙兽种类似，有尾、四足前进、牙齿进化完善，并且全身有鳞甲覆盖，其中也有像冰狼龙这样可以在特殊条件下两足前进的存在。几乎全部都是食肉动物，而且大多数都很擅长用前腿和牙齿攻击。
牙龙种的叫声大多也十分接近兽类，如雷狼龙、冰狼龙的叫声接近狼嚎，怨虎龙的叫声接近虎啸等。
外观设计主要分三派：
研究认为牙龙种和兽龙种关系最近。就形态看，牙龙种其实也很像西方的兽龙（Drake），或合弓纲的早期形态。
MH4中首次出现，以拥有龙和蛇类动物身体特性为特征的怪物种类，归属于蛇龙目。
外观设计主要分两派：
蛇龙种的形态非常像西方的Wrym，一种外形与蛇相差无几的龙，在这一种群之下还有有翼无脚的翼蛇（Amphiptere）和只有一对肢体的蛇龙（Lindworm，又名林德虫），两种形态分别对应了已知的两种蛇龙种所具备的形态。
不算作为联动物种的遗存种的话，蛇龙种是迄今为止成员数量最稀少的怪物种类。
自MHW出现的怪物种类，外形与翼龙相似，但身体结构更接近蝙蝠或小体型的飞龙种，一部分个体具有攻击能力。虽然外观和飞龙种很相似，但分类不是龙盘目而是单独的翼龙目，因此是跟飞龙差异极巨大的两类生物。
没有大型怪物。代表为行翼龙、酸翼龙等。
家养翼龙可以带着猎人进行短途旅行。主角就在帆船撞上熔山龙后，设法抓住了一只翼龙得以脱困。
各种哺乳类的集合，牙兽种是其中唯一的怪物种类。
值得一提的是虽然游戏内会存在一些野生的兽人种敌人（如野生艾露猫、梅拉露、新大陆奇面族和兽缠族等），且此类敌人有时也会被归类为怪物，但从世界观的角度来说兽人种更倾向于人型种族而非怪物，并且新作中也开始改用兽人族称呼它们，因此将兽人种/兽人族视为兽类怪物是明显不妥的。
由于草率的分类体系，一些兽类也会被分到食草种名下。
和食草种的精灵鹿、雪山鹿、波波那些没什么危害性的兽类不同，牙兽种全部都是兼具大体型和高危害性的动物。牙兽一定是兽类，兽类不一定是牙兽。
部分牙兽具有社会性，会以家族或别的形式形成族群，并且会选出它们的兽王。
外观设计主要分三派：
按照科学分类法，第一派和第二派都属于尖爪目，其中第一派和第三派属于尖爪目名下的坚爪亚目，第二派则分别属于坚齿亚目和飞膜兽亚目。第四派成员较少但比较杂，比如野猪是偶蹄目、巨兽是长鼻目。
也就是各种节肢动物的大集合，像什么甲虫啦、螃蟹啦、蜘蛛啦之类的。
自MH1就开始登场，以鞘翅目昆虫形态的怪物为主的怪物种类。
此外还有体型较大，危险程度较高的大型怪物，代表为重甲虫、阁螳螂等。
与拥有红色血液的龙类和兽类怪物不同，甲虫种怪物的血液大多呈现绿色。甲虫种死亡时，大多会以背面朝上、肢体卷曲并高频率抽搐的姿势断气。
值得一提的是，一部分甲虫种拥有一定程度的智能，比如重甲虫会与彻甲虫联手作战、阁螳螂能够从地底挖出古代武器对付猎人等。
首次出现在MH4中的怪物种类。
此类怪物因与蜘蛛相似的特征（如织网、行走方式等）而被划分出来。代表为影蜘蛛、妃蜘蛛等。
如果把小型动物也算上，那么MHW和MHRise里作为环境生物登场的一些小蜘蛛也可以算在里面。考虑到螯肢亚门同时包括了蛛形纲、肢口纲和海蛛纲等多个动物类群，那么MHW里作为环境生物登场的几种鲎似乎也可以归类到铗角种？
和甲虫种怪物一样，铗角种怪物的血液也是绿色的，并且死亡时也会以背面朝上、肢体抽搐的姿势断气。
“铗角种”这个日语名字来自日语词“铗角亚门”，这个词等同于汉语中的“螯肢亚门”一词。不过，毫无疑问，现实中的“铗角”指的是这类动物用于辅助进食或打架用的螯肢，是它们身体前端的第一对附肢；而MH里的铗角则更像是由第一对步足，也就是第三对附肢演化出来的。
或许是由于技术限制，目前出现的铗角种怪物皆是四足行走而非像现实里的蜘蛛那般八足行走。
以拥有软甲纲十足目身体构造为特征的怪物种类，血液大多为蓝色。
代表为盾蟹、镰蟹等，也存在如砦蟹这样的庞然大物。
对应的自然是现实中的两栖纲。名下只有一个分类。
MH4中首次出现，以拥有两栖类动物特性为特征的怪物种类。
目前已知的两栖种全部属于有尾目，四足爬行、水陆两生是它们最大的特点，代表为鬼蛙等。
一些小型物种，如瓦斯蛙一家众生平等蛙作为环境生物登场于MHW。
对应现实中的头足纲生物，名下目前仅一个分类。
以章鱼、乌贼一类的头足纲动物为原型的怪物种类，此类怪物的特点是躯干呈圆形，躯干下方生有8根触手，胸前的一对触手较为短小，口部生于腹部下方。目前暂未发现水栖的头足种，且目前已知的头足种产卵数量都极大，幼体体型小且能够在空中漂浮。
头足种怪物成体的名字在简体中文版皆以“蛸（shāo）”为后缀，繁体中文版则以“鱆（zhāng）”为后缀，两者皆有“章鱼”的意思。