lantell篇研究文章,篇编辑专评!具有里程碑意义的工作!单细胞转录组图谱为理解叶片维管细胞作用迈出了重要一步eplants

2020年,对于全球无数的科研人员来说,是充满挑战和挫折的一年。因此,报告一项具有里程碑意义的拟南芥叶片维管系统单细胞RNA测序(scRNA-seq)研究是一件令人倍感振奋的事。ScRNA-seq能够研究转录组中细胞间的变异,从而可以评估转录的随机性,从而加深对细胞功能的理解,揭示新的细胞类型,并揭示未知的发育途径。  作者首先优化了原生质体分离方案来富集了维管细胞,并验证了叶片细胞的相对丰度没有改变,因此从原生质体获得的scRNA-seq数据应该基本上涵盖了成熟叶片中的所有细胞类型。修改后的原生质体技术采用了“胶带夹层”的共聚焦成像技术--本质上是用双面胶带剥离背面表皮,去除毛状体、保卫细胞和表皮细胞,丰富维管系统的细胞类型,特别是韧皮部薄壁细胞。  他们从两个生物学重复样品中,获得了5230个单细胞转录本,从这些数据中,他们确定了19种不同的细胞类型,涵盖了所有已知的主要叶细胞类型。本研究中,他们选择将重点放在叶片维管系统上,包括木质部薄壁组织、韧皮部薄壁组织(PP)、伴生细胞(CC)和原形成层(见图)。

鲜为人知的发现:  1. 作者发现了拟南芥中PP的新作用,PP在拟南芥的韧皮部活性装载中起着重要作用。  首先,PP细胞被分成两个不同的簇Cluster,与编码外流转运蛋白的SWEET基因相关;一个簇富含与钙质沉积相关的基因,另一个簇则代表与光合作用活性相关的基因。未来的工作将寻求确定这些簇是否代表了空间上不同的细胞类型或发育轨迹。  其次,已知编码氨基酸输出子的UmamiT基因家族成员的表达在PP簇中富集,并与SWEET基因共表达,这使得作者推测UmamiT可能像SWEET对蔗糖的作用一样,在PP的氨基酸外流中发挥作用。  最后,bZIP家族的成员被确认为PP和其他细胞类型中与功能相关的膜转运蛋白的共同调节者。  2. 发现PP细胞和筛子元件CC复合体细胞具有不同的功能,并提供了划分成明显不同的簇的证据。  PP细胞似乎与原形成层和木质部关系更为密切。此外,编码一种已知能促进韧皮部分化的转录因子的APL在CC簇中表达丰富,但在PP簇中没有表达。此外,APL突变体显示PP标记的正常表达,表明APL可能不参与PP的形成。  3. 叶维管细胞和根维管细胞的比较  作者将来自叶片韧皮部簇的标记与根的scRNA-seq研究确定的韧皮部标记进行了比较(Wendrich等人,2020年)。这一比较揭示了有趣的相似和不同之处,表明在根中可能存在一种尚未鉴定的细胞类型,其特性类似于叶PP。

同时,该文章还提供了许多其他有趣的观察和丰富的数据和资源可供进一步研究,例如,与原形成层细胞分化、细胞类型特异性表达模式以及维管鞘细胞代谢图谱相关的数据和资源。  同时,在一份配套手稿(Bezrutczyk等人,2021年,)中,同一小组的成员使用scRNA-seq研究了维管束鞘细胞的分化,并揭示了远轴束鞘细胞在玉米韧皮部负载中的作用。这两项研究展示了这项技术的力量,促进了我们对植物发育过程的理解,并为不久的将来的重大新发展铺平了道路。甜!

与许多其他农作物相比,玉米的生产率要高得多。在其进化过程中发展出的特殊叶片解剖结构和特殊形式的光合作用(称为C4)使玉米的生长比同类植物快得多。因此,玉米需要更有效的运输策略以将光合作用过程中产生的光同化物分配到整个植物中。  该工作,研究人员发现了玉米韧皮部加载机制,该机制以前没有被描述过-围绕脉管系统的束鞘是实际运输诸如糖或氨基酸之类化合物的地方。该机制的发展可能是朝着更高的运输速率迈出的决定性的进化步骤,这使得玉米植物特别成功和有用。  叶片是不对称的,对近轴和远轴组织具有不同的功能。在玉米中,利用单细胞RNA测序技术对C4玉米的BS分化进行了研究。发现,蔗糖转运蛋白(SWEET)作用于叶片背面的“束鞘细胞”(维管束鞘细胞组成C4植物特有的细胞结构“花环状结构”)。Abaxial BS(abBS)细胞特异性表达3种SWEET13a、b和c和UmamiT氨基酸外排转运蛋白。在韧皮部薄壁组织(PP)中也检测到SWEET13a、b、c的mRNAs。发现玉米已经获得了一种韧皮部装载机制,其中ABBS细胞提供了蔗糖向韧皮部运输的主要途径。作者推测,abBS同一性受背腹模式的影响,并具有PP同一性的成分。这些观察结果为abBS细胞独特的运输特性提供了洞察力,并支持对玉米中典型的韧皮部装载途径的修饰。  HHU的博士生兼第一作者Margaret Bezrutczyk强调:“乍看之下,排列在花环中的束鞘细胞看起来是相同的。我们使用的单细胞测序方法首次使我们能够区分不同类型的束鞘细胞,我们希望借助这种技术,将来会发现更多的细胞类型,尤其是维管束中的那些细胞类型。”  该研究所所长弗洛默教授强调了这一发现的意义,他说:“玉米植物由于其C4光合作用而非常有生产力。可以想象,通过将玉米的负载机制转移到这些作物上,可以提高水稻或其他农作物的生产力。

参考资料下载

聂教授

新型纤维及复合材料制备技术

博士

洪教授

医学影像诊断技术

硕士

陈教授

建筑业

博士

郑教授

其他

博士

陈教授

现代农业

本科

肖教授

其他

博士

倪教授

生物治疗技术和基因工程药物

博士

吕教授

循环流化床燃烧理论与技术生物质燃烧煤粉燃烧与气化燃烧过程中污染物控制气液两相流与水动力

博士

张教授

输电技术

博士

预算:5000万元

山西 运城市 闻喜县

预算:面议

山东 淄博市

预算:面议

四川 眉山

预算:面议

陕西 西安市 莲湖区

预算:面议

广西壮族自治区 桂林

预算:面议

广西壮族自治区 桂林

运用语义分析技术解析技术需求,智能化快速锁定与技术需求相匹配的科技成果、技术专家、高校/科研院所等科研端信息;辅助提供二级联想词,增加对技术信息的捕捉,满足用户更多的匹配需求。

[政府园区]

基于地方产业发展需求,在全国范围精准挖选与地方产业相匹配的高层次人才、高技术项目资源,通过主题对接活动、重点项目考察等形式撮合地方招引部门与人才、项目的深度对接,促成高层次人才、高技术项目在地方落地。

[政府园区]

科技特派员在线登记、日志填写、技术需求推送、业绩提交审核、推优评审的工作平台。

[政府园区]

促进高校、科研院所等的科技成果、技术能力向产业、企业进行转移转化与应用服务对象:高等学校、科研院所、大型企业

[高校院所]

智能制造是大势所趋,然而企业在智能制造转型升级中往往会遇到要不要转、转什么、往哪里转、找谁转等难题,需要有专业资源、专业服务提供。科易网帮助企业找到靠谱、专业的服务资源。

[企业服务]

人才是创新创业的核心要素。基于技术的复杂性、创新的持续性,以及研发和生产的周期性,企业除了解决当下生产经营中的技术问题,同时也应主动规划和实施符合自身战略目标的技术人才结构与布局!

THE END
0.文献分享比克氏棉子叶单细胞转录图谱解析了色素腺体发育色素腺体(pigment gland)是棉属(Gossypium)特有的防御结构,其主要内含物棉酚在棉花病虫害抗性中起重要作用,但因其对人类和动物的毒性,反而限制了棉籽中丰富的油分及蛋白质的利用。比克氏棉(Gossypium bickii)具有优良的“子叶色素腺体延缓形成”性状,其色素腺体在种子萌发过程中形成,是研究色素腺形态建成的理想材料。jvzquC41yy}/lrfpuj{/exr1r1>c7:k:c4:f7l
1.跨平台多物种单细胞解决方案MobiNova在高通量单细胞研究中的应用空间转录组技术可以解析胚胎发育过程中细胞谱系分离的空间组织和分子结构。结合空间和单细胞多组学,将解决基本问题,并为许多发育和疾病研究提供新见解。 4. 单细胞测序在植物育种中的应用 (1)异质性研究 单细胞转录组技术揭示了植物不同细胞类型的异质性,发现了如根静止中心细胞、侧根原基细胞、保卫细胞及韧皮部jvzquC41yy}/drt/gs{jr7hqo1yiq€ftvkimg7furAOE?=:535=:7<
2.10X单细胞转录组、单细胞核转录组、VDJ、空间转录组联合分析识别除了呼吸功能外,肺还有重要的屏障功能。 虽然肠道和鼻咽等其他黏膜屏障组织通过明确定义的黏膜相关淋巴组织 (MALT) 协调适应性免疫,但在健康人肺中尚未报道此类次级淋巴结构。 The LungMAP and Human Lung Cell Atlas consortia利用单细胞和单核 RNA 测序方面的最新技术进步,生成了许多表征小鼠和human肺细胞类型的图谱jvzquC41yy}/lrfpuj{/exr1r1ifek;3g2;cd?
3.文献分享水稻种胚单细胞时空图谱从空间分布来看,细胞类型和空间位置还是比较一致的(图2A)。根据以往其它胚乳切片的信息,还多一个细胞类型RC(root cap),所以总共有14个细胞类型。作者推断RC应该在4个时间点都存在的,但是由于截面角度问题,并不是所有时间点都能看到RC的结构。 基于作者建立的细胞分割流程,也基于无监督的方法进行了聚类和注释,并jvzquC41yy}/lrfpuj{/exr1r1;26@fc8f?f7=
4.第一节植物细胞的基本结构分布:薄壁细胞中,尤以各类贮藏器官更为集中,如种子胚乳、子叶、块根、块茎、球茎、根茎等更为丰富。 淀粉粒结构形成:造粉体在形成淀粉粒时,由一个中心开始,由内向外层层沉积,中心即脐点(hilium),层层沉积,出现层纹(annular striation lamellae),因淀粉沉积时,直链淀粉与支链淀粉相互交替分层沉积,二者亲水性有异,jvzq<84yyy4489iqe0ipo8hqpvkov8751372;86317;63A6:;a722=:587;:0|mvon
5.46.【地球生物全系列——从单细胞到人类】原生生物界—红藻门子不能游动,随水流至果胞,与受精丝接触受精;除部分物种外,大部分存在世代交替现象。1.形态特征(1)外形特征红藻门的植物体藻体一般 较小,高约10厘米左右,少数可超过一米以上。藻体有简单的丝状体,也有形成假薄壁组织的叶状体或枝状体。假薄壁组织的种类中,有单轴和多 jvzq<84yyy4489iqe0ipo8iqewsfp}4461694>4421?8;>54:a725;7:74970|mvon
6.上海交通大学优秀博士学位论文及提名论文上海交通大学2024年优秀博士学位论文名单 上海交通大学2024年优秀博士学位论文提名论文名单 上海交通大学2023年优秀博士学位论文名单 上海交通大学2023年优秀博士学位论文提名论文名单 上海交通大学2022年优秀博士学位论文名单 上海交通大学2022年优秀博士学位论文提名论文名单 jvzquC41yy}/i|3ulv{/gmz0ep5qq|y1fgzbku4\5O€OFtB
7.一种细胞类型特异性的调控子,负责控制单萜类吲哚生物碱的生物合成过程通过单细胞RNA测序技术,我们分析了*C. acuminata*茎中不同细胞类型的基因表达情况,并发现MIA合成基因主要在一种极为罕见的细胞群体中表达,这表明MIA的合成在植物中是高度特化的。这种细胞群体可能与*C. roseus*中的内部韧皮部相关薄壁细胞(IPAP)类似,后者是MIA合成的重要部位。此外,其他合成步骤则在表皮细胞中jvzquC41yy}/gknqvtgeg7hqo1tfy|k14286/:6142863:6522756@>450nuo
8.孙博华教授团队:玻璃海绵启发的点阵结构优化及低速冲击响应在学习了一些文献之后仍然一筹莫展,在这种关键时刻,我学习到了余同希、卢国兴、张雄三位老师的著作:《能量吸收:结构与材料的力学行为和塑性分析》,对各种结构和材料的能量吸收都有详细的叙述。其中“多胞薄壁构件”中张雄教授等人的理论正好可以为我所用,经过计算,完美地解释了“BSHC吸能性能更好”这个结论。这一次jvzquC41koz/zjzcv0kew7hp1ktgq8622:545?60jvs
9.单细胞生物的共同特征范文导语:如何才能写好一篇单细胞生物的共同特征,这就需要搜集整理更多的资料和文献,欢迎阅读由公文云整理的十篇范文,供你借鉴。 篇1 程序化细胞死亡(Programmed cell death,PCD)是一种可以去除受寄生虫感染的细胞的机制,然而在宿主细胞中寄生虫又可以诱导或者抑制宿主细胞的凋亡。近些年来发现原虫也会发生程序化细胞jvzquC41yy}/i€~qq0ipo8mcqyko1;:255:/j}rn
10.2018年研究生创新项目拟立项名单有偏技术进步、产业结构变迁与金属资源需求演变 省级项目 4 162101004 陈子恒 21数学与统计学院单冬勇 22物理与电子学院 0702 物理学 博士研究生 碳纳米材料空间辐照损伤机理研究 校级一般项目基于量纲分析的薄壁管吸能特性预测及其应用 校级一般项目 204 174201029 刘承光 42交通运输工程jvzquC41orh/e|z0gf{/ew4kphu039;5137337mvo
11.植物组织培养(全)指出在烟草髓组织培养中,根和茎的分化是生长素对细胞分裂素比率的函数,通过改变培养基中这两类生长调节物质的相对浓度可以控制器官的分化:这一比率高时促进生根,低时促进茎芽的分化。二者浓度相等时,组织则趋向于以一种无结构的方式生长。后来证明,激素可调控器官发生的概念jvzquC41o0972mteu0tfv8iqe1>e3@6;62910qyon
12.下图为植物细胞结构模式图.请据图回答.(1)细胞最外层坚韧的薄壁是下图为植物细胞结构模式图,请据图回答。(1)细胞最外层坚韧的薄壁是[①] ,起保护和支持细胞的作用。(2)植物细胞和动物细胞具有的基本结构包括 [②] 、[④] 、和 [⑥] 三部分。(3)水果中的汁液通常存在于细胞的[⑤] 中。(4)遗传物质主要存在于 (填序号)中。jvzq<84yyy422:5lkcpjcx3eqo5d|||1ujoukhucige7:B;7
13.位于植物细胞最外层的结构是()A.细胞壁B.细胞膜C.细胞质D.细胞核【答案】分析:此题考查植物细胞的基本结构和功能.细胞壁、细胞膜细胞核、细胞质.植物细胞的细胞质里有液泡和叶绿体.解答:解:细胞壁是植物细胞最外层透明的薄壁,具有保护和支持细胞的作用;细胞膜,近似球形,紧贴细胞壁内侧,非常薄,在光学显微镜下不容易看清楚,起保护作用并控制物质进出的作用;细胞核,含有遗jvzq<84yyy422:5lkcpjcx3eqo5d|||1ujoukhnfaf
14.荧光假单胞菌的培养特征与分离筛选及作用机制!荧光假单胞菌属薄壁菌门假单胞菌科假单胞菌属,属于rRNAI群荧光假单胞菌DNA同源组。荧光假单胞菌DNA同源群包括荧光假单胞菌、铜绿假单胞菌和恶臭假单胞菌,是一种革兰阳性杆菌,以不产绿脓素而产荧光素而得名。为环境污染菌。对人类是少见机会病原菌,可从伤口、痰、胸水、尿和血液中分离出,亦可从血库血中jvzquC41yy}/kwxvtwsfp}3eqo4dp8xwrrrjg{x1UJ716@691pkxuh;799=50qyon